アンソレイエ学園の理事長室から一つの懐中時計が忽然と姿を消した。

それは創設者C.L.ヴァレンタインに由来する、学園の象徴とも言える”時の記念品”だった。

生徒のアルテミス、セレネ、ティリット、リベルタの4人は、ふとしたことから奇妙な暗号文と出会い、事件の裏に何か深い謎があることに気づく。