名門・アンソレイエ学園。ある日、校長室から一つの懐中時計が忽然と姿を消した。
それは創設者C.L.ヴァレンタインに由来する、学園の象徴とも言える”時の記念品”だった。

生徒のアルテミス、セレネ、ティリット、リベルタの4人は、ふとしたことから奇妙な暗号文と出会い、事件の裏に何か深い謎があることに気づく。