2058年、日本。 突如、時空の歪みによって現れた 地球外生命体『Zodiac(ゾディアック)』。 この緊急事態を危惧した日本政府は、 急遽『地球外生命体特務捜査対策本部』、 通称ESTを設立した。 地球がゾディアックからの襲来を受けて一年。 高校2年の春を迎えようとしていた青年、 巫狩(いがり)イツキはとある事件に巻き込まれる。 イツキはその事件の中でその場にいた小川慶二、 水野蒼とともに特殊な力を得てしまい、 それをきっかけに彼らはESTの特殊部隊、通称『ZAQ』と行動を共にすることになってしまう。 目まぐるしく変化していく状況に戸惑いを隠せない3人。 しかしそれもつかの間、3人とZAQ一行の前に突然、 謎の小型ゾディアックが現れこう告げる。 それはこの先、多くのゾディアックがこの国に襲来してくるであろうという事だった。 ゾディアックの襲来によって、 平穏がいとも簡単に崩れ去っていく……。 イツキ達はかつての平和を取り戻せるのか？ ゾディアックの襲撃を防ぐ事は出来るのか？ イツキ達の運命がいま、変わり始める……！！ ※この作品はフィクションです。実在の人物・団体とは関係ありません。